電力中央研究所 報告書(電力中央研究所報告)
報告書データベース 詳細情報
報告書番号
U03008
タイトル(和文)
イヌワシを頂点とする生態系の解明 --DNA解析による野生動物の糞内容物からの餌植物同定--
タイトル(英文)
Study on the ecosystem sustaining a pair of Golden Eagles -Identification of food plants by DNA analysis from animal feces-
概要 (図表や脚注は「報告書全文」に掲載しております)
植物食の動物の糞内容物からDNA解析を用いて餌植物を同定する方法について検討した。まず、亜高山帯から山地帯にかけて生育している植物700種を採集し、rbcL遺伝子の一部領域の塩基配列を決定し、DNAデータベースを作成した。DNA配列の比較から、364種の同定と112種の近縁種の推定が可能であることが示された。このデータベースを用い、野外で採取したノウサギ糞のDNAからrbcL遺伝子の解析領域をPCRで増幅し、餌植物の推定を試みた。検出されたDNAはすべてデータベース内のDNAと一致し、植物種を推定することができた。同様に、カモシカやヤマドリの糞から抽出したDNAからも植物種を推定することができたことから、本方法は植物食の動物の糞から餌植物推定に汎用的に利用できると考えられた。
概要 (英文)
Identification of species fed on by wild animals is necessary to understand food webs.We have developed a PCR-based method for identifying food plants from phytophagous animals feces. Nucleotide sequences of partial rbcL gene (the chloroplast gene coding for the large subunit of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/ oxygenase) were determined in 700 plant species collected from the subalpine to mountain zone.Of the 476 unique sequences obtained from these sequence data base, 364 sequences were species specific. Using information from this data base, a molecular identification of food plants from hare feces sampled from the same area was performed. PCR-amplified partial rbcL sequences from hare feces DNA were detected in the data base and plant species fed on the hare were identified. Similary, this approach was applied to identify food plants from feces of Japanese serow and copper pheasant. These results suggested that PCR-based method is applicable a tool for identification of food plants in the diets of phytophagous animals.
報告書年度
2003
発行年月
2003/08
報告者
担当 | 氏名 | 所属 |
---|---|---|
主 |
松木 吏弓 |
我孫子研究所応用生物部 |
共 |
島野 光司 |
信州大学 理学部物質循環学科 |
共 |
阿部 聖哉 |
我孫子研究所応用生物部 |
共 |
矢竹 一穂 |
(株)セレス 環境調査部 |
共 |
竹内 亨 |
我孫子研究所応用生物部 |
共 |
白木 彩子 |
北海道環境科学研究センター 自然環境部野生動物科 |
共 |
石井 孝 |
我孫子研究所環境科学部 |
共 |
梨本 真 |
我孫子研究所応用生物部 |
キーワード
和文 | 英文 |
---|---|
糞 | feces |
餌植物 | food plants |
同定 | identification |
DNA解析 | DNA analysis |
rbcL | rbcL |